Alonso boucle un tour en 1m23.973, 1.095 secondes devant la Toyota Gazoo Racing TS050-Hybrid n°7 et 1.7 seconde devant la première voiture non hybride, la R13-Gibson Rebellion Racing n°3 de Thomas Laurent. L'Aston Martin Racing Vantage n°95 signe le meilleur temps de la journée en LMGTE avec Nicki Thiim à son volant, qui boucle le tour en 1m37.659 pour terminer la deuxième séance d'essais libres des 6 Heures du week-end Fuji en tête de la feuille de temps. Son chrono est près d’une seconde plus rapide que le meilleur temps de la séance du matin. La Ford GT n°67 de Harry Tincknell se classe deuxième, à 0.162s derrière la voiture de tête. La Ferrari F488 AF Corse n°71 termine troisième devant les deux Porsche 911.

Signatech Alpine, vainqueur des 24 Heures du Mans, est en tête en LMP2 grâce à Andre Negrao qui signe le meilleur tour en 1m30.410, quatre dixièmes devant les deux Oreca Jackie Chan DC Racing, la n°38 devançant la n°37 de 0.1 seconde.

Les deux Porsche Dempsey-Proton Racing terminent en tête de la catégorie LMGTE AM avec un temps au tour d’1m38.989 réalisé par Matteo Cairoli dans la 911 n°88, 0.163s devant Matt Campbell au volant de la Porsche n°77.

La troisième séance d'essais libres aura lieu demain matin à 09h30 (heure locale) / 02h30 (CET) et sera prolongée de 60 minutes à 90 minutes en raison du temps perdu sous drapeau rouge lors des deux premières séances.

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